日本模擬国連には、二つの事務局があります。関東事務局には、五つの研究会と三つの支部があります。関西事務局には、二つの研究会と一つの支部があります。研究会と支部では一年を通して、「通常活動」と呼ばれる模擬国連会議を行っています。

関東事務局

早稲田研究会

国立研究会

四ッ谷研究会

日吉研究会

駒場研究会

宇都宮支部

筑波支部

九州支部

関西事務局

京都研究会

神戸研究会

北陸支部